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蛋白质的带电性取决于溶液的pH。一般,当溶液pH高于蛋白的等电点(pI)是,蛋白质会带负电荷,结合到带正电荷的阴离子交换填料上。当溶液pH小于蛋白的等电点时,蛋白带正电,结合到带负电的阳离子交换填料上。典型的,当pH高于蛋白的等电点(PI)时,蛋白质会结合到带正电荷的阴离子交换剂上。在等电点以下时,蛋白质会结合到带负电荷的阳离子交换剂上。
在离子交换层析中,蛋白质会在低离子强度下结合在层析介质上。接下来通过提高盐浓度或改变pH使得结合的蛋白洗脱下来。洗脱方式可以选择连续梯度洗脱或分步洗脱。
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