Cy3和Cy5单活性功能马来酰亚胺特别适用于选择性标记含有游离巯基的分子，例如蛋白质，肽和寡核苷酸中的半胱氨酸残基。

它们也可用于抗体标记，因为染料分子会避开抗体结合位点，从而标记分子的功能不受损害。

该方案简单而稳健，当需要更高的标记选择性或使用Cy3和Cy5 NHS酯的标记不可取或不合适时，提供了另一种化学方法。

每个试剂盒包含五个小瓶的染料，每个小瓶足以标记1毫克蛋白质。