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PCR-Free让我们的劳动更有价值!

发布时间:2019-05-01 14:22 点击:0次 来源:深圳华大智造科技有限公司

“五一国际劳动节”

是世界上80多个国家的全国性节日

它是全世界劳动人民共同拥有的节日

所以,今天要讲劳动?

还是PCR扩增?

NO! ! 以劳动的名义

我!们!要!PCR-Free!

全基因组测序被广泛应用于人类疾病研究、动植物基因组研究、微生物基因组研究等。传统全基因测序在样本制备中通常都会用PCR方法进行文库构建,这种方法虽然能够适用于较低起始量的样本建库,但在PCR过程中,会导致基因组部分复杂区域丢失或者引入扩增错误。为了让基因组数据保真度更高,华大智造研发团队经过两年研发,推出重量级新品MGIEasy PCR-Free DNA文库制备试剂套装。

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这款试剂套装全流程无PCR扩增步骤,使用1μg 基因组DNA仅需3.5个小时就能获得高准确度的全基因组文库。相比于传统WGS测序,利用MGIEasy PCR-Free DNA文库制备试剂套装获得的变异检测性能,尤其是InDel检测灵敏度和准确性等方面已达到业界领先水平,无PCR扩增错误累积,基因组覆盖均一性好,变异检测性能优,实现了建库+测序全流程的“真”“正”“准”和“快”,能够最大程度还原基因组真实原貌。这款试剂盒适用于华大智造多款测序平台,如MGISEQ-2000、BGISEQ-500等。

建库+测序全流程,无指数扩增,无扩增bias,无扩增错误累积

更均一的基因组覆盖度,覆盖GC富集区域、启动子、重复区域

更优秀的变异检测性能,InDel检测的灵敏度和准确性达业内领先水平

无需PCR过程,仅需3.5小时完成文库构建

 

数据展示

由于建库过程中去除了PCR扩增步骤,利用MGIEasy PCR-Free DNA文库制备试剂套装获得的文库(简称MGI WGS PCR-Free文库)无PCR引入的错误或者bias。结合MGI DNBSEQTM测序技术利用滚环复制进行DNA纳米球(测序模板)的制备(原理如图1所示),可以避免基于PCR指数扩增引入的测序错误累积,最大限度的保证基因组的真实性

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图1:MGIEasy PCR-Free DNA文库制备过程

 

 

 

正:更高的基因组覆盖均一性

1-利用MGIEasy PCR-Free DNA文库进行不同GC含量的对比实验

选择3种不同GC含量的细菌,分别是OlsenellaProfusa,62%;E.coli, 50%;Bacillus megaterium, 38%, 均采用1 μg gDNA为起始量,物理打断,MGIEasy PCR-Free DNA文库制备试剂套装建库,基于MGIESEQ-2000 进行PE150测序和分析。结果如图2所示,高GC菌(62%)和低GC菌(38%)的基因组覆盖均一性和中GC菌(50%)类似,接近理想的基因组覆盖度,说明MGI WGS PCR-Free在不同GC含量的样本中可以实现均一的覆盖

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图2:不同GC含量的细菌的GC bias示意图

图释:将Reference 和实测数据均以100bp划分窗口,统计每个窗口的GC 含量后按照0-100%分类排序,统计每个GC含量百分比内的窗口数量,再将每个GC含量百分比内的实测窗口数除以Reference窗口数,得到均一化的覆盖度,用蓝色点表示。灰色水平线表示理想的归一化覆盖度,表示为1.0, 蓝色点线表示样本的实际归一化的覆盖度。蓝色点线约接近1.0, 说明样本的基因组覆盖均一性越好。

 

2-利用MGIEasy PCR-Free DNA文库与MGIEasy DNA文库的对比实验

以1μg 人标准品NA12878起始,物理打断,采用MGIEasy PCR-Free DNA文库制备试剂套装和传统WGS试剂盒分别建库,然后基于MGISEQ-2000平台进行 PE150测序, 截取30X数据进行分析。结果显示,同传统的WGS PCR相比较,WGS PCR-Free的测序深度频率分布(图3-左图,红色柱状图)更趋接近于泊松分布的理想的测序深度频率(图3-左图,蓝色线状图),说明WGS PCR-Free的测序数据具有更好的基因组覆盖均一性

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图3:WGS PCR-Free和WGS PCR测序深度频率分布图

 

准:超级优秀的InDel变异检测性能

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图4:比较不同测序平台的WGS PCR-Free和WGS PCR的变异检测性能

 

快:无需PCR,文库构建仅需3.5小时

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图5:PCR-Free VS PCR建库流程

 

一颗彩蛋

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邀您新品尝鲜

参与征集劳动节“花式应用”

TOP5应用案例赢取免单机会

 

活动时间:2019.05.01-2019.06.30

活动地区:仅限中国大陆地区

活动规则:凡在活动期间抢鲜购买MGIEasy PCR-Free DNA文库制备试剂套装,均有机会参与评选;参评案例将在活动结束后公开展示,公式周期至少一个月;获票数目最高的前5名应用单位/应用案例将有机会赢取全额免单机会,即在活动期间为尝试“花式应用”所购买的MGIEasy PCR-Free DNA文库制备试剂套装费用全额返还。

注:本次活动解释权归华大智造市场部所有。

 

订购信息

产品

MGIEasy PCR-Free DNA文库制备试剂套装

规格

16 RXN

96 RXN

货号

1000013452

1000013453