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GC-Orbitrap/MS结合高分辨代谢物数据库 在合成生物学非靶向代谢物分析的应用研究

发布时间: 2023-08-28 12:26 来源:赛默飞色谱与质谱

制药、农业以及加工制造业对特种化合物的巨大需求,一直是现代化学 工业面临的巨大挑战之一。而现代化学工业需要在日益严格的监管审查 情况下,不得不提出环境友好型的生产方法。由合成生物学和科技驱动 的生物技术方法被认为是有潜力能够提供必要的持续解决方案。合成生 物学的核心是将“设计-构建测试框架1”应用于重新设计的天然生物系 统内以实现目的。通过在微生物(例如大肠杆菌2和链霉菌属3)的“ 生物工厂”中插入和微调遗传信息,组装复杂的酶促途径以实现化学物 质的快速和多样化生成。像异丙基β-D-1-硫代吡喃半乳糖苷(IPTGLac启动子)或四环素(Tet启动子)这样的诱导型细菌启动子,通常用 于激活基因转录,开启工程化生物合成途径。然而,人们还未完全掌握 这些诱导系统与整个细菌代谢组的相互作用,尤其是毒副作用方面的影 响。 

本研究的目的是研究不同增长条件下,如何应用非靶向代谢组学了解诱 导剂类型和浓度对工程菌(含有IPTG诱导型红色荧光蛋白表达质粒pBbA1a-RFP的大肠杆菌DH5α)代谢指纹谱图的影响。这种表型信息有可能为上游基因调控提供参考,同时也可更好地定义该启动子 在生化途径表达中的最有效用途。