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首页> 产品展示> Illumina RNA Prep with Enrichment

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生物分子

Illumina RNA Prep with Enrichment

品牌 厂商性质 产地 货期
Illumina因美纳 生产商 美国 现货

性能特点

以卓越的捕获效率和覆盖度均一性实现对大量靶基因的快速靶向检测。

在线咨询 询底价
产品参数
货号 规格 操作
20040536 Library Prep Illumina RNA Prep with Enrichment (L),酶切法片段化(16样本) 询底价
20040537 Illumina RNA Prep with Enrichment (L),酶切法片段化(96样本) 询底价
20027213 Index Adapters IDT for Illumina - DNA/RNA UD Indexes Set A,酶切法片段化(96标签,96样本) 询底价
20027214 IDT for Illumina DNA/RNA UD Indexes Set B,酶切法片段化(96标签,96样本) 询底价
20020183 Panel Illumina Exome Panel–仅含富集寡核苷酸 询底价
20044311 Respiratory Virus Oligos Panel V2 询底价
20044763 Services Illumina RNA Library Prep with Enrichment Training 询底价
20040540 配件产品 Illumina RNA Fast Hyb Enrichment (16 Samples) 询底价
20040542 Illumina RNA Prep, (L) Tagmentation (16 Samples) 询底价
产品介绍

以卓越的捕获效率和覆盖度均一性实现对大量靶基因的快速靶向检测。

产品特色

Illumina RNA Prep with Enrichment采用On-Bead Tagmentation技术和简化的单一杂交实验,可为基于RNA的文库制备和富集提供超快速的工作流程。

快速、简单且可扩展的工作流程

总时间不到9小时,制备和富集文库的手动操作时间不到2小时。与TruSeq RNA Exome相比,此工作流程至少可节省50%的时间。我们将通过自动化合作伙伴提供Illumina认证的自动化选项。

从复杂样本中获取高质量数据

仅需10 ng来自新鲜或冷冻样本的总RNA,或20 ng来自降解样本(例如FFPE)的总RNA即可实现高灵敏度。

价格优惠且专注

获取目标转录组编码区,只需中度测序深度即可获取大量信息。Illumina RNA Prep with Enrichment可提供出色的捕获效率和覆盖度均一性,极大地减少所需的测序深度,实现无偏差的准确检测。每个富集反应只需2.5 µL探针。

灵活的模块化Panel设计

您可以从各种经过验证的预先构建的探针池中选择,也可以自定义自己的探针以获得更大的灵活性。使用新的唯一双标签组C和D(即将推出),一次运行可以对384个样本进行多重分析。模块化设计可对目标区域开展多种RNA-Seq应用,从而进行检测和发现研究,例如等位基因特异性表达、融合检测、生物标志物筛选等。

RNA外显子组功能

实现对大量靶基因的快速靶向检测,包括RNA外显子组。Illumina RNA Prep with Enrichment可与Illumina Exome Panel一起使用,该panel的探针组经过了高度的优化,可全面覆盖编码RNA序列。Illumina Exome Panel包含超过425,000个探针,每个都根据NCBI37/hg19参考基因组构建,覆盖了98%以上的RefSeq外显子组。此组探针可捕获超过214,000个目标,涵盖了21,415个目的基因。  

呼吸道病毒检测

Respiratory Virus Oligo Panel可对常见的呼吸道病毒(包括冠状病毒株)进行高度灵敏的检测和鉴定。即使在高度变异区域,用于基于杂交捕获的靶向富集的寡核苷酸探针仍然有效,能靶向快速进化的RNA病毒。Respiratory Virus Oligo Panel与Illumina RNA Prep with Enrichment一起使用。

规格

Description一种可重现且经济的解决方案,可使用多种类型的样本和起始材料来检测和发现目标转录本,包括福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织和其他低质量样本
Content Specifications与Illumina Exome Panel一起使用时可捕获编码转录组
Assay Time<9小时
Hands-On Time<2小时
Input Quantity10 ng新鲜/冷冻样本来源的总RNA,或20 ng FFPE样本来源的总RNA
Mechanism of Action连接磁珠的转座酶
Multiplexing多达384个唯一双标签序列(UDI)
Species Details兼容的物种取决于所使用的panel
System Compatibility Details文库制备被设计为与所有Illumina测序系统兼容,并在NextSeq 500/550和NovaSeq 6000系统上进行了大量的检验。
Strand SpecificityNon-Stranded
System CompatibilityHiSeq 2500, HiSeq 3000, HiSeq 4000, iSeq 100, MiniSeq, MiSeq, NextSeq 1000, NextSeq 2000, NextSeq 500, NextSeq 550, NovaSeq 6000
Automation Capability液体处理机器人
MethodmRNA Sequencing, 靶向RNA测序, 靶向富集
Species Category人类, Virus
Specialized Sample TypesBlood, FFPE Tissue, Low-Input Samples
Variant ClassNovel Transcripts, Transcript Variants, 单核苷酸多态性 (SNPs), 基因融合, 转录变异
Nucleic Acid TypeRNA
Technology测序

计划推荐

仪器推荐的样本数读长
NextSeq 550 SystemIllumina RNA Prep with Enrichment + Exome Panel
中通量: 5
高通量: 16
(基于每个样本25M read)
2 × 100 bp
NextSeq 2000 SystemIllumina RNA Prep with Enrichment + Exome Panel
P2: 16
P3: 40
(基于每个样本25M read)
2 × 100 bp
NovaSeq 6000 SystemIllumina RNA Prep with Enrichment + Exome Panel
SP: 32
S1: 64
S2: 164
S4: 384
(基于每个样本25M read)
2 × 100 bp
MiSeq System, MiSeqIllumina RNA Prep with Enrichment + Respiratory Virus Oligo Panel
Up to 25 samples (基于每个样本1M read)
2 × 75 bp
MiniSeq SystemIllumina RNA Prep with Enrichment + Respiratory Virus Oligo Panel
Up to 25 samples (基于每个样本1M read)
2 × 75 bp
NextSeq 550 SystemIllumina RNA Prep with Enrichment + Respiratory Virus Oligo Panel
Up to 384 samples (基于每个样本1M read)
2 × 75 bp

产品比较


Illumina RNA Prep with EnrichmentTruSeq RNA ExomeIllumina Stranded mRNA Prep
Assay Time<9小时约两天6.5小时
Automation Capability液体处理机器人液体处理机器人液体处理机器人
Content Specifications与Illumina Exome Panel一起使用时可捕获编码转录组捕获编码转录组/RNA外显子组捕获编码转录组(带链信息)
Description一种可重现且经济的解决方案,可使用多种类型的样本和起始材料来检测和发现目标转录本,包括福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织和其他低质量样本为研究人员提供清晰、全面的编码转录组视图,链信息精确且样本起始量低。简单、经济的编码转录组分析解决方案,可提供精确的链信息
Hands-On Time<2小时约11小时<3小时
Input Quantity10 ng新鲜/冷冻样本来源的总RNA,或20 ng FFPE样本来源的总RNA10 ng新鲜/冷冻样本来源的总RNA,或20 ng FFPE样本来源的总RNA25-1000 ng标准质量的总RNA
Mechanism of Action连接磁珠的转座酶以编码RNA为靶标的生物素化的捕获探针。不要求RNA带有poly-A尾巴。PolyA捕获,连接接头和标签
MethodmRNA Sequencing , 靶向RNA测序 , 靶向富集Exome Sequencing , mRNA SequencingmRNA Sequencing
Multiplexing多达384个唯一双标签序列(UDI)多达24个单标签、96个组合(CD)双标签多达384个唯一双标签序列(UDI)
Technology测序测序测序
Variant ClassNovel Transcripts, Transcript Variants, 单核苷酸多态性 (SNPs), 基因融合, 转录变异Novel Transcripts, Transcript Variants, 单核苷酸多态性 (SNPs), 转录变异Novel Transcripts, Transcript Variants, 单核苷酸多态性 (SNPs), 基因融合, 转录变异

Method-Specific Workflow Example

000.jpg

支持数据和图像

病毒富集panel可检测的病毒
  • 人冠状病毒229E

  • 人冠状病毒NL63

  • 人冠状病毒OC43

  • 人冠状病毒HKU1

  • SARS-CoV-2

  • 人腺病毒B1型

  • 人腺病毒C2型

  • 人腺病毒E4型

  • 人博卡病毒1型(灵长类博卡病毒1型分离株st2)

  • 人博卡病毒2c型PK分离株PK-5510

  • 人博卡病毒3型

  • 人副流感病毒1型

  • 人副流感病毒2型

  • 人副流感病毒3型

  • 人副流感病毒4a型

  • 人类偏肺病毒(CAN97-83)

  • 呼吸道合胞病毒(A型)

  • 人类呼吸道合胞病毒9320(B型)

  • 甲型流感病毒(A/Puerto Rico/8/1934(H1N1))

  • 甲型流感病毒(A/Korea/426/1968(H2N2))

  • 甲型流感病毒(A/New York/392/2004(H3N2))

  • 甲型流感病毒(A/goose/Guangdong/1/1996(H5N1))

  • 人博卡病毒4型NI病毒株HBoV4-NI-385

  • KI多瘤病毒Stockholm 60

  • WU多瘤病毒

  • 人双埃柯病毒1型PicoBank/HPeV1/a

  • 人双埃柯病毒6型

  • 人鼻病毒A89

  • 人鼻病毒C型(病毒株024)

  • 人鼻病毒B14

  • 人类肠病毒C104病毒株:AK11

  • 人类肠病毒C109分离株NICA08-4327

  • 甲型流感病毒 (A/Zhejiang/DTID-ZJU01/2013(H7N9))

  • 甲型流感病毒 (A/Hong Kong/1073/99(H9N2))

  • 甲型流感病毒 (A/Texas/50/2012(H3N2))

  • 甲型流感病毒 (A/Michigan/45/2015(H1N1))

  • 乙型流感病毒 (B/Lee/1940)

  • 乙型流感病毒 (B/Wisconsin/01/2010)

  • 乙型流感病毒 (B/Brisbane/60/2008)

  • 乙型流感病毒 (B/Colorado/06/2017)

  • 乙型流感病毒 (B/Washington/02/2019)

  • 人类对照基因

试剂盒中有7,800个探针可检测呼吸道病毒、当前的流感病毒株和SARS-CoV-2,还包含作为阳性对照的人类探针。这些探针是80-mer寡核苷酸,彼此间隔很近,可完全覆盖panel中所有病毒的基因组。


Illumina RNA Prep with Enrichment delivers a fast workflow

Supporting Data and Figures

On-Bead Tagmentation and a single, 90-minute hybridization step combine to deliver a faster workflow with fewer steps compared to TruSeq RNA Exome.

High-quality data from low input samples

Supporting Data and Figures

Illumina RNA Prep with Enrichment achieves high data concordance between input amounts of 10 ng and 100 ng total RNA from universal human reference (UHR). UHR RNA libraries were sequenced on a NovaSeq 6000 System, subsampled to 25M clusters per library. Data was analyzed with the BaseSpace RNA-Seq Alignment v 1.1.1 app.

Detection of BCR-ABL1 gene fusion

Supporting Data and Figures

Libraries prepared from 10 ng RNA from the K-562 cell line using Illumina RNA Prep with Enrichment and the Illumina Exome Panel resulted in successful detection of the BCR-ABL1 gene fusion. Top alignment track shows all reads, bottom track shows only reads supporting the BCR-ABL1 fusion gene.

Gene fusion detection
Fusion (source)RINRNA inputDetection
BCR-ABL 1 (K-562)7.410 ng6/6 replicates (100%)
TPM3-NTRK1 (colorectal cancer)2.520 ng6/6 replicates (100%)
Coverage of coding regions with Illumina RNA Prep with Enrichment

Supporting Data and Figures

Libraries prepared from 10 ng UHR RNA and 20 ng FFPE RNA using Illumina RNA Prep with Enrichment and the Illumina Exome Panel show more than 85% of the data generated aligned to transcripts (coding and UTRs). Data from TruSeq RNA Exome libraries are shown for comparison.


Illumina RNA Prep with Enrichment信息由Illumina因美纳(中国)科学器材有限公司为您提供,如您想了解更多关于 Illumina RNA Prep with Enrichment报价、型号、参数等信息,欢迎来电或留言咨询。

注:该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案,不可用于临床诊断或治疗等相关用途