His 标签蛋白纯化预装柱
由于组氨酸标签很小并几乎不会干扰目的蛋白的功能、活性或结构，因此被广泛使用。固定化金属离子亲合层析（IMAC）是纯化组氨酸标签蛋白最常用的方法。选择性地负载共价金属离子（比如镍或钴）的IMAC层析介质能够截留组氨酸标签蛋白，并在变性条件下，能从包涵体中纯化出不溶性的组氨酸标签蛋白。成功的IMAC纯化能得到高纯度、高产率、高活性的目的蛋白。
因为很多蛋白质有内在的组氨酸和/或半胱氨酸氨基酸残基，其他非特异的蛋白能够与目的蛋白一起结合到IMAC填充介质上。这种情况下，需要经常通过改变溶液中咪唑的浓度来优化结合、洗涤和洗脱的条件。增加结合和洗涤缓冲液中咪唑的浓度通常会降低非特异性结合，而更低的浓度则导致更强的亲和相互作用。找到合适的平衡非常关键。
MBP-标签蛋白纯化预装柱
麦芽糖结合蛋白（MBP）是一种有用的亲和标签，它们能增加生成目的蛋白的表达水平和溶解性。MBP标签也促进依附蛋白合适的折叠。因为MBP能增加溶解性，这个标签对以不溶形式（包涵体）聚集的重组蛋白特别有用。
亲和纯化在生理条件下发生，并且使用麦芽糖进行温和地洗脱。温和的洗脱能保留住MBP标签蛋白的活性。
Strep-tag™ II标签蛋白纯化预装柱
Strep-tag™II是一个只有8个氨基酸的小标签，它的相对分子量只有1000。它的小尺寸非常有好处，因为在绝大多数情况下它不会干扰结构和功能研究，因此无需去除。
Strep-tag™ II特异性地结合拥有固定在琼脂糖基底基质的StrepTactin™配体的StrepTactin™ Sepharose High Performance以获得到高纯度的目的蛋白。Strep-tag™ II与该配体的结合亲和力是链霉亲和素的近100倍，使其适合于纯化Strep-tag™II蛋白。在生理条件下进行纯化，含有脱硫生物素的温和洗脱液保留了目的蛋白的活性。
GST-标签蛋白纯化预装柱
谷胱甘肽s-转移酶(GST) 基因融合系统是用于从大肠杆菌中生产的GST-标签蛋白的表达、纯化和检测的通用系统。可在非常温和的条件下对GST-标签蛋白进行纯化，从而保留目的蛋白的功能和抗原性。
GST标签可能增加目的蛋白的溶解性和稳定性。GST标签很大，其相对分子量（Mr）为26000。一段特殊的切割序列允许在纯化后用不同的蛋白酶简单地去除GST标签。
GST-标签蛋白的典型特点是与谷胱甘肽琼脂糖层析介质上的谷胱甘肽配体高特异性的结合，一个步骤就能使洗脱的目的分子的纯度超过90%
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