在计算机分子模拟理论方面，本团队具有雄厚的实力及丰富的从业经验，能够在很短的时间内搭建起计算机酶分子改造平台，并以此为基础完成高质量的蛋白质结构模建、结合模式预测、分子对接以及蛋白质设计工作。除了掌握业界常用的各种主流蛋白质模拟软件的理论原理及操作，我们还拥有多款原创的分子模拟程序，可以完成各种特有的、高效的分子改造工作。
分子对接
掌握分子对接技术，可进行小分子、蛋白质、DNA、RNA等多种形式的分子对接，以及小分子数据库的虚拟筛选。所用软件涉及Autodock、GOLD、SurFlex、Z-Dock、RosettaDock、Hex等学术和商业软件以及自行开发的对接软件。
图 Cetuximab单克隆抗体与EGFR复合物模型
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BioGenius具有蛋白质组数据丰富的分析处理经验。分析内容涉及：原始数据蛋白鉴定分析，蛋白修饰分析，蛋白质结构域分析，蛋白质相互作用分析，蛋白质结构建模分析，采用分子动力学模型预测蛋白-蛋白对接与蛋白-配体对接及其结合位点等。
蛋白质组是对蛋白质特别是其结构和功能的大规模研究。蛋白质组学比基因组学要复杂得多。基因组是相当稳定的实体，而蛋白质组通过与基因组的相互作用而不断发生着改变。一个生命体在其机体的不同部分以及生命周期的不同阶段，其蛋白表达可能存在巨大的差异。
常用的定量蛋白组学技术有：iTRAQ技术，LC-MS/MS技术等。
质谱平台
