TruSight Oncology 500
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此分析方法靶向多种变异类型，包括肿瘤突变负荷（TMB）和微卫星不稳定性（MSI），即使是低质量样本同样适用。产品特色TruSight Oncology 500是新一代测序（NGS）检测方法，支持肿瘤样本的全景基因组图谱分析。它能够鉴定各种肿瘤
| 货号 | 规格 | 操作 |
|---|---|---|
| 20028213 | TruSight Oncology 500 DNA Kit (48 样本) | 询底价 |
| 20028214 | TruSight Oncology 500 DNA Kit，配合NextSeq使用（48样本） | 询底价 |
| 20028215 | TruSight Oncology 500 DNA/RNA Bundle, （16标签，24样本） | 询底价 |
| 20028216 | TruSight Oncology 500 DNA/RNA Bundle，配合NextSeq使用（16标签，24样本） | 询底价 |
| 20032624 | TruSight Oncology 500 DNA Kit，外加PierianDx解读报告（16标签，48样本） | 询底价 |
此分析方法靶向多种变异类型，包括肿瘤突变负荷（TMB）和微卫星不稳定性（MSI），即使是低质量样本同样适用。
产品特色
TruSight Oncology 500是新一代测序（NGS）检测方法，支持肿瘤样本的全景基因组图谱分析。它能够鉴定各种肿瘤类型中涉及的所有相关DNA和RNA变异。
此外，它还能准确测量关键免疫疗法生物标记：肿瘤突变负荷（TMB）和微卫星不稳定性（MSI）。
通过检测整合节省时间、费用和样本
泛癌内容与关键指南和临床试验相匹配
DNA和RNA分析靶向523个基因，可评估小变异、TMB、MSI、剪接变异和融合
从单一生物标志物检测转向单个全面的NGS检测，可增加发现阳性生物标志物的机会
从样本到结果的精简工作流程
在4-5天内完成从初始样本到结果整个流程
自动化试剂盒和方法可减少手动操作时间，实现可扩展性
由PierianDx Clinical Genomics Workspace（CGW）软件提供支持，轻松将原始数据转换为最终解读报告。
获得可信度高的结果
杂交捕获化学试剂与精密的生物信息学相结合，可实现高分析特异性和灵敏度
富集测序化学技术包括独特的分子标签（UMI），可实现高灵敏度的变异检测
以成熟的Illumina平台为基础
支持内部全景变异分析
将样本和数据保存在内部，以便更好地控制和构建数据库
支持未来的检测，可检测新发现的生物标志物
TruSight Oncology 500产品家族
家族中的所有三种检测均旨在鉴定指南和临床试验中的重要生物标志物。
TruSight Oncology 500检测
使用TruSight Oncology 500检测评估FFPE肿瘤组织的关键癌症生物标志物。
TruSight Oncology 500 High-Throughput（大样本量）检测
使用与TruSight Oncology 500检测相同的生物标志物和组织类型时，一次最多可批量处理192份样本。
TruSight Oncology 500 ctDNA检测
使用TruSight Oncology 500 ctDNA检测分析血浆中的循环肿瘤DNA。
规格
| Gene Count | 523个基因的DNA、55个基因的RNA |
|---|---|
| Content Specifications | 靶向523个目标基因的DNA，55个基因的RNA，panel总共1.94 Mb。 • 指南覆盖范围：广泛覆盖多种实体瘤的重要指南 • 临床试验覆盖范围：超过1,000项临床试验 • 免疫肿瘤学生物标志物覆盖范围：涵盖MSI生物标志物，以及新发现的生物标志物TMB、POLE1和POLD1 |
| Hands-On Time | Manual: ~10.5 hrs Automated: ~2.5 hrs |
| Input Quantity | 40 ng DNA, 40 ng RNA |
| Mechanism of Action | 目标富集工作流程 |
| Multiplexing | 多达8重 |
| Analytical Specificity | 99.9998% (对于SNV检测) |
| Analytical Sensitivity | > 96% |
| Variant Class | Transcript Variants, 单核苷酸位点变异 (SNV), 基因融合, 拷贝数变异 (CNVs), 插入缺失 (indels), 转录变异 |
| Method | 靶向DNA测序, 靶向RNA测序, 靶向富集 |
| Cancer Type | 泛癌种 |
| Species Category | 人类 |
| System Compatibility | NextSeq 500, NextSeq 550, NextSeq 550Dx in Research Mode |
| Nucleic Acid Type | DNA, RNA |
| Technology | 测序 |
| Automation Capability | 液体处理机器人 |
| Specialized Sample Types | FFPE Tissue |
产品比较
| TruSight Oncology 500 | TruSight Oncology 500 High-Throughput（大样本量方案） | TruSight Oncology 500 ctDNA | |
|---|---|---|---|
| Cancer Type | 泛癌种 | 泛癌种 | 泛癌种 |
| Content Specifications | 靶向523个目标基因的DNA，55个基因的RNA，panel总共1.94 Mb。 • 指南覆盖范围：广泛覆盖多种实体瘤的重要指南 • 临床试验覆盖范围：超过1,000项临床试验 • 免疫肿瘤学生物标志物覆盖范围：涵盖MSI生物标志物，以及新发现的生物标志物TMB、POLE1和POLD1 | 靶向523个目标基因的DNA，55个基因的RNA，panel总共1.94 Mb。 • 指南覆盖范围：广泛覆盖多种实体瘤的重要指南 • 临床试验覆盖范围：超过1,000项临床试验 • 免疫肿瘤学生物标志物覆盖范围：涵盖MSI生物标志物，以及新发现的生物标志物TMB、POLE1和POLD1 | 靶向选择523个基因（完整编码序列），panel总共1.94 Mb。 • 指南覆盖范围：广泛覆盖多种实体瘤的重要指南 • 免疫肿瘤学生物标志物覆盖范围：TMB和MSI* |
| Hands-On Time | Manual: ~10.5 hrs Automated: ~2.5 hrs | 约10.5小时 | Manual: ~10.5 hrs Automated: N/A |
| Input Quantity | 40 ng DNA, 40 ng RNA | 40 ng DNA, 40-80 ng RNA (至少需要2 mm3 FFPE组织) | 30 ng cfDNA（8-10 ml血浆） |
| Method | 靶向DNA测序 , 靶向RNA测序 , 靶向富集 | 靶向DNA测序 , 靶向RNA测序 , 靶向富集 | 靶向DNA测序 , 靶向富集 |
| Nucleic Acid Type | DNA, RNA | DNA, RNA | DNA |
| Specialized Sample Types | FFPE Tissue | FFPE Tissue | Blood, 游离DNA |
| Species Category | 人类 | 人类 | 人类 |
| System Compatibility | NextSeq 500 , NextSeq 550 , NextSeq 550Dx in Research Mode | NovaSeq 6000 | NovaSeq 6000 |
| Technology | 测序 | 测序 | 测序 |
| Variant Class | Transcript Variants, 单核苷酸位点变异 (SNV), 基因融合, 拷贝数变异 (CNVs), 插入缺失 (indels), 转录变异 | Transcript Variants, 单核苷酸位点变异 (SNV), 基因融合, 拷贝数变异 (CNVs), 插入缺失 (indels), 转录变异 | 体细胞变异, 单核苷酸位点变异 (SNV), 基因融合, 拷贝数变异 (CNVs), 插入缺失 (indels) |
具体的方法工作流程范例
支持数据和图像
TruSight Oncology 500与全外显子组测序的TMB测量结果之间的高度一致性
MSI状态的量化评估对比MSI-PCR评分
采用仅含肿瘤样本或肿瘤-正常工作流程的可重现TMB评估
低变异等位基因频率下的小变异检测
TruSight Oncology 500的内容符合NCCN指南
| 泛癌生物标记物 NTRK1 NTRK2 NTRK3 MSI TMB (新发现) | ||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 肺癌 | 黑色素瘤 | 结肠癌 | 卵巢癌 | 乳腺癌 | 胃癌 | 膀胱癌 | 骨髓癌 | 肉瘤 |
| AKT1 | BRAF | AKT1 | BRAF | AKT1 | BRAF | MSH5 | ABL1 | ALK |
| ALK | CTNNB1 | BRAF | BRCA1 | AR | KIT | PMS2 | ASX1 | APC |
| BRAF | GNA11 | HRAS | BRCA2 | BRCA1 | KRAS | TSC1 | CALR | BRAF |
| DDR2 | GNAQ | KRAS | KRAS | BRCA2 | MET | CEBPA | CDK4 | |
| EGFR | KIT | MET | PDGFRA | ERBB2 | MLH1 | ETV6 | CTNNB1 | |
| ERBB2 | MAP2K1 | MLH1 | FOXL2 | FGFR1 | PDGFRA | EZH2 | ETV6 | |
| FGFR1 | NF1 | MSH2 | TP53 | FGFR2 | TP53 | FLT3 | EWSR1 | |
| FGFR3 | NRAS | MSH6 | PIK3CA | GATA2 | FOXO1 | |||
| KRAS | PDGFRA | NRAS | PTEN | IDH1 | GLI1 | |||
| MAP2K1 | PIK3CA | PIK3CA | IDH2 | KJT | ||||
| MET | PTEN | PMS2 | JAK2 | MDM2 | ||||
| NRAS | TP53 | PTEN | KIT | MYOD1 | ||||
| PIK3CA | SMAD4 | MPL | NAB2 | |||||
| PTEN | TP53 | NPM1 | NF1 | |||||
| RET | RUNX1 | PAX3 | ||||||
| TP53 | SF3B1 | PAX7 | ||||||
| TMB | SRSF2 | PDGFRA | ||||||
| TP53 | PDGFRB | |||||||
| SDHB | ||||||||
| SDHC | ||||||||
| SMARCB1 | ||||||||
| TFE3 | ||||||||
| WT1 | ||||||||
表中列出的基因和生物标记只是panel所含基因的一部分。如需查看完整的基因列表，请参阅本页面“产品资料”部分中的产品数据表。
* 评估DNA和RNA变异所采用的产品为TruSight Oncology 500 DNA/RNA Bundle。
