可对FFPE样本进行全景变异分析,具有更大的灵活性,每个流动槽可批量处理多达192个样本。
产品特色
TruSight Oncology 500 High-Throughput(大样本量方案)检测是在TruSIght Oncology 500检测的基础上构建的,具有更高的样本通量和批处理选项的灵活性。
将多种生物标志物检测整合到一项检测中
从样本到结果的精简工作流程
样本通量高
获得可信度高的结果
支持内部全景变异分析
TruSight Oncology 500产品家族
家族中的所有三种检测均旨在鉴定指南和临床试验中的重要生物标志物。
TruSight Oncology 500检测
使用TruSight Oncology 500检测评估FFPE肿瘤组织的关键癌症生物标志物。
TruSight Oncology 500 High-Throughput(大样本量)检测
使用与TruSight Oncology 500检测相同的生物标志物和组织类型时,一次最多可批量处理192份样本。
TruSight Oncology 500 ctDNA检测
使用TruSight Oncology 500 ctDNA检测分析血浆中的循环肿瘤DNA。
规格
Gene Count | 523个基因的DNA、55个基因的RNA |
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Content Specifications | 靶向523个目标基因的DNA,55个基因的RNA,panel总共1.94 Mb。 • 指南覆盖范围:广泛覆盖多种实体瘤的重要指南 • 临床试验覆盖范围:超过1,000项临床试验 • 免疫肿瘤学生物标志物覆盖范围:涵盖MSI生物标志物,以及新发现的生物标志物TMB、POLE1和POLD1 |
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Hands-On Time | 约10.5小时 |
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Sample Throughput | 16–192个样本/流动槽 |
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Input Quantity | 40 ng DNA, 40-80 ng RNA (至少需要2 mm3 FFPE组织) |
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Mechanism of Action | DNA和RNA杂交捕获工作流程 |
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Multiplexing | 192个IDT for Illumina Nextera DNA UD Indexes(用于TSO500 HT DNA和RNA文库) |
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Analytical Specificity | 99.9998% (对于SNV检测) |
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Analytical Sensitivity | > 96% |
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Species Category | 人类 |
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Variant Class | Transcript Variants, 单核苷酸位点变异 (SNV), 基因融合, 拷贝数变异 (CNVs), 插入缺失 (indels), 转录变异 |
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Technology | 测序 |
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Method | 靶向DNA测序, 靶向RNA测序, 靶向富集 |
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Nucleic Acid Type | DNA, RNA |
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System Compatibility | NovaSeq 6000 |
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Specialized Sample Types | FFPE Tissue |
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Cancer Type | 泛癌种 |
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产品比较
| TruSight Oncology 500 High-Throughput(大样本量方案) | TruSight Oncology 500 | TruSight Oncology 500 ctDNA |
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Cancer Type | 泛癌种 | 泛癌种 | 泛癌种 |
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Content Specifications | 靶向523个目标基因的DNA,55个基因的RNA,panel总共1.94 Mb。 • 指南覆盖范围:广泛覆盖多种实体瘤的重要指南 • 临床试验覆盖范围:超过1,000项临床试验 • 免疫肿瘤学生物标志物覆盖范围:涵盖MSI生物标志物,以及新发现的生物标志物TMB、POLE1和POLD1 | 靶向523个目标基因的DNA,55个基因的RNA,panel总共1.94 Mb。 • 指南覆盖范围:广泛覆盖多种实体瘤的重要指南 • 临床试验覆盖范围:超过1,000项临床试验 • 免疫肿瘤学生物标志物覆盖范围:涵盖MSI生物标志物,以及新发现的生物标志物TMB、POLE1和POLD1 | 靶向选择523个基因(完整编码序列),panel总共1.94 Mb。 • 指南覆盖范围:广泛覆盖多种实体瘤的重要指南 • 免疫肿瘤学生物标志物覆盖范围:TMB和MSI* |
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Hands-On Time | 约10.5小时 | Manual: ~10.5 hrs Automated: ~2.5 hrs | Manual: ~10.5 hrs Automated: N/A |
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Input Quantity | 40 ng DNA, 40-80 ng RNA (至少需要2 mm3 FFPE组织) | 40 ng DNA, 40 ng RNA | 30 ng cfDNA(8-10 ml血浆) |
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Method | 靶向DNA测序 , 靶向RNA测序 , 靶向富集 | 靶向DNA测序 , 靶向RNA测序 , 靶向富集 | 靶向DNA测序 , 靶向富集 |
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Nucleic Acid Type | DNA, RNA | DNA, RNA | DNA |
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Sample Throughput | 16–192个样本/流动槽 |
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Specialized Sample Types | FFPE Tissue | FFPE Tissue | Blood, 游离DNA |
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Species Category | 人类 | 人类 | 人类 |
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System Compatibility | NovaSeq 6000 | NextSeq 500 , NextSeq 550 , NextSeq 550Dx in Research Mode | NovaSeq 6000 |
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Technology | 测序 | 测序 | 测序 |
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Variant Class | Transcript Variants, 单核苷酸位点变异 (SNV), 基因融合, 拷贝数变异 (CNVs), 插入缺失 (indels), 转录变异 | Transcript Variants, 单核苷酸位点变异 (SNV), 基因融合, 拷贝数变异 (CNVs), 插入缺失 (indels), 转录变异 | 体细胞变异, 单核苷酸位点变异 (SNV), 基因融合, 拷贝数变异 (CNVs), 插入缺失 (indels) |
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* Based on PierianDx Clinical knowledgebase, as of March 2020
具体的方法工作流程范例
支持数据和图像
准确评估TMB状态
TruSight Oncology 500和TruSight Oncology 500 High-Throughput(大样本量方案)的TMB分析结果高度一致。
准确评估MSI状态
TruSight Oncology 500和TruSight Oncology 500 High-Throughput(大样本量方案)的MSI分析结果高度一致。
TruSight Oncology 500和TruSight Oncology 500 High-Throughput(大样本量方案)的CNV检测结果高度一致
低频变异检测
TruSight Oncology 500和TruSight Oncology 500 High-Throughput(大样本量方案)的VAF分析结果高度一致。
可靠地检测融合和剪接变异
使用TruSight Oncology 500在NextSeq 500系统上检测到的融合和剪接变异。数值代表每个样本在标明的RNA起始量下支持的read数量。RNA融合的阈值是5;剪接变异的阈值是10。
TruSight Oncology 500的内容符合多种癌症类型的关键指南
多种癌症类型的基因组肿瘤分析生物标记
TruSight Oncology 500和TruSight Oncology 500 High-Throughput(大样本量方案)的内容包含多种癌症类型的关键指南生物标记,以及现有和新兴的泛癌种生物标记,例如TMB、MSI、NTRK1、NTRK2和NTRK3。