Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus
品牌 | 厂商性质 | 产地 | 货期 |
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Illumina因美纳 | 生产商 | 美国 | 订货 |
性能特点
使用多种样本快速制备文库,以极大的灵活性来研究编码和非编码转录组。
货号 | 规格 | 操作 |
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20040525 | Library Prep Illumina Stranded Total RNA Prep, Ligation with Ribo-Zero Plus (16样本) | 询底价 |
20040529 | Illumina Stranded Total RNA Prep, Ligation with Ribo-Zero Plus (96样本) | 询底价 |
20040553 | Index Adapters IDT for Illumina RNA UD Indexes Set A, Ligation (96标签,96样本) | 询底价 |
20040554 | IDT for Illumina RNA UD Indexes Set B, Ligation (96标签,96样本) | 询底价 |
20044764 | Services Illumina Stranded Total RNA Library Prep培训 | 询底价 |
使用多种样本快速制备文库,以极大的灵活性来研究编码和非编码转录组。
产品特色
Illumina Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus为编码RNA和多种形式的非编码RNA的分析提供了卓越的性能。能够可靠地揭示替代转录本、基因融合和等位基因特异性表达。
卓越的性能
Illumina Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus是基于TruSeq连接技术,自2011年起已被至少9926篇文献引用。该连接方法具有覆盖度均一性高、链信息精确的优势,即使采用降解的样本也能进行可靠的文库制备。
灵活的研究设计
Illumina Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus支持较宽的RNA起始量范围(1 ng–1000 ng)。*它兼容多种类型样本,包括福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)及其他低质量样品。配备的Ribo-Zero Plus可从多个物种的样本(包括人类、小鼠、大鼠、细菌和流行病学样本)中去除大量RNA。
快速、自动化的工作流程
仅7个小时就可以完成文库制备。Illumina将通自动化合作伙伴提供经Illumina认证的自动化方法。
可扩展的测序
在单次运行中可多重分析最多384个样本。(Index Set A和B已上市,Set C和D即将推出。)每次运行测序的样本数量取决于测序仪的通量。
*该起始量范围适用于高质量的RNA。为获得理想结果,针对FFPE或降解样本,我们推荐的起始量为10 ng。
规格
Description | 用于多种类型样本的全转录组测序研究。包含Ribo-Zero plus模块,一个试管即可去除多个物种的转录本。 |
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Content Specifications | 捕获编码RNA以及多种形式的非编码RNA。 |
Assay Time | 约7小时 |
Hands-On Time | <3小时 |
Input Quantity | 对于标准质量RNA样本,可使用1–1000 ng的总RNA。对于FFPE样本,建议最少使用10 ng的总RNA,以获得理想效果。 |
Mechanism of Action | 酶法rRNA去除,连接接头和标签 |
Multiplexing | 多达384个唯一双标签序列(UDI) |
Species Details | 包含Ribo-Zero Plus,用于去除多个物种的转录本,包括人类细胞质和线粒体rRNA、小鼠rRNA、大鼠rRNA、细菌革兰氏+/- rRNA和人β珠蛋白转录本。 |
System Compatibility Details | 文库制备被设计为与所有Illumina测序系统兼容,并在NextSeq 500/550和NovaSeq 6000系统上进行了大量的检验。 |
System Compatibility | HiSeq 2500, HiSeq 3000, HiSeq 4000, NextSeq 1000, NextSeq 2000, NextSeq 500, NextSeq 550, NovaSeq 6000 |
Variant Class | Novel Transcripts, Transcript Variants, 单核苷酸多态性 (SNPs), 基因融合, 转录变异 |
Species Category | 人类, 小鼠, Virus, 大鼠, 细菌 |
Specialized Sample Types | FFPE Tissue, Low-Input Samples |
Strand Specificity | Stranded |
Technology | 测序 |
Automation Capability | 液体处理机器人 |
Method | 全转录组测序 |
Nucleic Acid Type | RNA |
计划推荐
仪器 | 推荐的样本数 | 读长 |
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NextSeq 550 System | 中通量: 2 高通量: 8 (基于每个样本50 M reads) | 2 × 75 bp |
NextSeq 2000 System | 全转录组分析: 每次运行8(P2)–20(P3)个样本(基于每个样本50 M reads) | 2 × 75 bp |
NovaSeq 6000 System | 全转录组分析: SP: 16 S1: 32 S2: 82 S4: 200 每次运行的样本数(基于每个样本50 M reads) | 2 × 75 bp |
产品比较
Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus | TruSeq Stranded Total RNA | TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero Globin | |
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Assay Time | 约7小时 | 11.5 hours | 11.5 hours |
Automation Capability | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 |
Content Specifications | 捕获编码RNA以及多种形式的非编码RNA。 | 捕获编码RNA以及多种形式的非编码RNA。 | 捕获编码RNA以及多种形式的非编码RNA。 |
Description | 用于多种类型样本的全转录组测序研究。包含Ribo-Zero plus模块,一个试管即可去除多个物种的转录本。 | For whole-transcriptome sequencing studies. The Total RNA version depletes cytoplasmic rRNA while the Total RNA Gold version depletes cytoplasmic and mitochondrial rRNA. | 用于血液来源RNA的全转录组测序研究。去除细胞质rRNA、线粒体rRNA和珠蛋白mRNA。 |
Hands-On Time | <3小时 | 5.5 hours | 5.5 hours |
Input Quantity | 对于标准质量RNA样本,可使用1–1000 ng的总RNA。对于FFPE样本,建议最少使用10 ng的总RNA,以获得理想效果。 | 0.1 – 1 ug high-quality total RNA. Lower-quality samples may require further optimization. | 0.1–1 ug血液来源的高质量纯化总RNA |
Mechanism of Action | 酶法rRNA去除,连接接头和标签 | 基于微珠的rRNA去除、cDNA合成和PCR | 基于微珠的rRNA去除、cDNA合成和PCR |
Method | 全转录组测序 | 全转录组测序 | 全转录组测序 |
Multiplexing | 多达384个唯一双标签序列(UDI) | 低通量试剂盒:混合最多12个样本。或混合24个样本(组A和B一起), 高通量试剂盒:使用组合双标签或唯一双标签序列制备96个带标签的样本。 | 高通量试剂盒:使用组合双标签或唯一双标签序列制备96个带标签的样本。, 低通量试剂盒:混合最多12个样本。或混合24个样本(组A和B一起) |
Species Category | Virus, 人类, 大鼠, 小鼠, 细菌 | 人类, 大鼠, 小鼠 | 人类, 大鼠, 小鼠 |
Technology | 测序 | 测序 | 测序 |
Method-Specific工作流示例
支持数据和图像
上方- 使用Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus去除多个物种的核糖核酸。Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus可在单试管反应中有效降低人类、小鼠、大鼠和细菌的rRNA浓度。将结果与TruSeq Stranded Total RNA配合Ribo-Zero Gold(哺乳动物种属)和Ribo-Zero Bacteria(大肠杆菌)的结果进行比较(枯草芽孢杆菌数据未显示)。下方- 使用Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus去除人外周血白细胞中的珠蛋白mRNA。
可减少的目标RNA种类
高覆盖度均一性
Illumina Stranded Total RNA Prep为(A)高质量和合成降解的UHR RNA(RIN = 2)和(B)起始量为100 ng和10 ng的FFPE RNA提供了高覆盖度均一性。FFPE样本的DV200质量分值为55%。所有文库都在NovaSeq 6000系统上以50 M reads进行测序。使用BaseSpace RNA-Seq Alignment App v2.0.1进行数据分析。
上方- 性能参数比较——将Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus与TruSeq Stranded Total RNA with Ribo-Zero进行比较。Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus更高效,尤其是在使用10 ng和1 ng的低起始量总UHR RNA的情况下。在NextSeq 550系统上对文库进行测序,下采样至30 M reads。通过下采样至4 M reads 来计算重复比例,并使用BaseSpace RNA-Seq Alignment App v2.0进行分析。下方- Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus 的性能参数。
高数据一致性
Illumina Stranded Total RNA Prep 在(A)1 ng和100 ng UHR RNA的起始量和(B)10 ng FFPE RNA的技术平行分析之间实现了高数据一致性。文库在NovaSeq 6000系统上以2 × 74 bp读长进行测序。使用BaseSpace RNA-Seq Alignment App v2.0.1进行数据分析。
Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus 工作流程
Illumina Stranded Total Prep提供了快速的工作流程,且手动操作时间短。时间长短会因使用的设备、处理的样本数量、自动化程序或用户经验而异。
上方- 使用Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus去除多个物种的核糖核酸。Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus可在单试管反应中有效降低人类、小鼠、大鼠和细菌的rRNA浓度。将结果与TruSeq Stranded Total RNA配合Ribo-Zero Gold(哺乳动物种属)和Ribo-Zero Bacteria(大肠杆菌)的结果进行比较(枯草芽孢杆菌数据未显示)。下方- 使用Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus去除人外周血白细胞中的珠蛋白mRNA。
Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus信息由Illumina因美纳(中国)科学器材有限公司为您提供,如您想了解更多关于Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus报价、型号、参数等信息,欢迎来电或留言咨询。
注:该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案,不可用于临床诊断或治疗等相关用途