1.使用高纯度气体，检查载气和尾吹气密封圈，检查气体过滤器（如果饱和，更换过滤器）、进样垫和衬管，更换色谱柱上的密封卡套、清洁喷嘴。
2. 小心将柱子前后各半卷舒展开来。
3. 将柱子轻松地挂在柱温箱内。
4. 将柱子两端用专用切割设备（硅片、玻璃刀）平均整齐地切去 3~5cm，注意千万不能用手去掰折。
5. 彻底地检查切口，如果切口不平整需要重新切割。
6. 挑选完好无损的柱卡套和固定螺母。
7. 将卡套和螺母装在色谱柱两端。
8. 将色谱柱两端分别安装至进样口和检测器。色谱柱两端进入进样口和检测器的深度要根据仪器厂商的要求来设定。通常对于分流 / 不分流进样口，色谱柱深入程度约为 2~3cm；对于 FID 检测器，色谱柱深入程度约为 1~2cm。不要为了确保合适的深入程度而反复将柱端与设备硬件碰触，这样会损坏色谱柱的端口，影响样品的引入。
9. 确定好端口的正确位置后，一手扶住色谱柱，用另一只手将柱螺母固定拧紧。之后再用尺寸合适的扳手将螺母完全紧实。注意不能拧过头，否则色谱柱会被挤碎。同时要确保色谱柱端口进入进样口的深度符合仪器厂商的要求。
10. 逐步设置好柱压力和气流参数。
11. 重复智能卡第9项内容将色谱柱安装至检测器上，确保色谱柱端口进入检测器的深度符合仪器厂商的要求。
12. 再次确保色谱柱完整安全地挂在柱温箱内，不要将两端的柱身展开过多，不然过度展开的柱身会在热循环中损坏。