TruSight Oncology 500 ctDNA
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靶向血浆中多种体细胞变异类型（包括肿瘤突变负荷（TMB）和微卫星不稳定性（MSI））的检测。产品特色TruSight Oncology ctDNA是新一代测序（NGS）泛癌检测方法，支持在内部使用血浆进行全景变异分析（CGP）。该panel的
| 货号 | 规格 | 操作 |
|---|---|---|
| 20039252 | Library Prep TruSight Oncology 500 ctDNA Kit (48样本) | 询底价 |
| 20043410 | TruSight Oncology 500 ctDNA Kit，外加PierianDx解读报告（16标签，48样本） | 询底价 |
| 20028314 | Reagents NovaSeq 6000 S2 Reagent Kit v1.5 (300个循环) | 询底价 |
| 20028312 | NovaSeq 6000 S4 Reagent Kit v1.5 (300个循环) | 询底价 |
| 20043131 | NovaSeq XP 4-Lane Kit v1.5 | 询底价 |
靶向血浆中多种体细胞变异类型（包括肿瘤突变负荷（TMB）和微卫星不稳定性（MSI））的检测。
产品特色
TruSight Oncology ctDNA是新一代测序（NGS）泛癌检测方法，支持在内部使用血浆进行全景变异分析（CGP）。
该panel的DNA内容与使用组织样本进行检测的对应产品（TruSight Oncology 500和TruSight Oncology 500 High-Throughput）相似，包含了关键的免疫肿瘤学（IO）生物标志物，这使其非常适合与珍贵组织样本结合使用或单独使用。
支持使用血浆的全景变异分析
泛癌CGP检测与关键指南和临床试验相匹配
DNA内容与TruSight Oncology 500相似，包括523个基因的完整编码序列
检测单核苷酸位点变异(SNV)、插入缺失、CNV、融合和IO生物标志物
通过集成的工作流程开展内部CGP
通过cfDNA结果简化的5天工作流程
由DRAGEN分析软件和DRAGEN Server v3支持的快速变异检出算法
可通过Pierian Dx Clinical Genomics Workspace获得全面的解读报告
获得可靠的结果
杂交捕获化学试剂、独特分子标签（UMI）以及精密的错误校正带来可信度更高的结果
包括独特的分子标签（UMI），可实现高灵敏度的变异检测
NovaSeq 6000提供的深度测序以及更经济的v1.5试剂盒
解锁液体活检，包含有价值的IO信息
获得血浆低水平变异检测所需的灵敏度和特异性
在有或没有珍贵组织样本的情况下，通过液体活检中开启CGP分析
1.94 Mb panel非常适合用于检测TMB和MSI等IO生物标志物（现有2400多个同聚物位点）
TruSight Oncology 500产品家族
家族中的所有三种检测均旨在鉴定指南和临床试验中的重要生物标志物。
TruSight Oncology 500检测
使用TruSight Oncology 500检测评估FFPE肿瘤组织的关键癌症生物标志物。
TruSight Oncology 500 High-Throughput（大样本量）检测
使用与TruSight Oncology 500检测相同的生物标志物和组织类型时，一次最多可批量处理192份样本。
TruSight Oncology 500 ctDNA检测
使用TruSight Oncology 500 ctDNA检测分析血浆中的循环肿瘤DNA。
规格
| Gene Count | 523个基因的DNA |
|---|---|
| Content Specifications | 靶向选择523个基因（完整编码序列），panel总共1.94 Mb。 • 指南覆盖范围：广泛覆盖多种实体瘤的重要指南 • 免疫肿瘤学生物标志物覆盖范围：TMB和MSI* |
| Hands-On Time | Manual: ~10.5 hrs Automated: N/A |
| Input Quantity | 30 ng cfDNA（8-10 ml血浆） |
| Mechanism of Action | 杂交捕获化学试剂 |
| Multiplexing | 在S2上可进行8重分析，在S4上可进行24重分析（使用Xp-4 Lane工作流程，最多16个标签） |
| Analytical Specificity | ≥99.995%（小变异，≥ 0.5% VAF） |
| Analytical Sensitivity | ≥95%（小变异，≥ 0.5% VAF） |
| Method | 靶向DNA测序, 靶向富集 |
| Variant Class | 体细胞变异, 单核苷酸位点变异 (SNV), 基因融合, 拷贝数变异 (CNVs), 插入缺失 (indels) |
| System Compatibility | NovaSeq 6000 |
| Species Category | 人类 |
| Specialized Sample Types | Blood, 游离DNA |
| Technology | 测序 |
| Nucleic Acid Type | DNA |
| Cancer Type | 泛癌种 |
计划推荐
| 仪器 | 推荐的样本数 | 读长 |
|---|---|---|
| NovaSeq 6000 System | 24 samples per run (S4 flow cell), 800M paired-end reads, 35,000x coverage | 2 × 150 bp |
| NovaSeq 6000 System | 8 samples per run (S2 flow cell), 800M paired-end reads, 35,000x coverage | 2 × 150 bp |
产品比较
| TruSight Oncology 500 ctDNA | TruSight Oncology 500 | TruSight Oncology 500 High-Throughput | |
|---|---|---|---|
| Cancer Type | 泛癌种 | 泛癌种 | 泛癌种 |
| Content Specifications | 靶向选择523个基因（完整编码序列），panel总共1.94 Mb。 • 指南覆盖范围：广泛覆盖多种实体瘤的重要指南 • 免疫肿瘤学生物标志物覆盖范围：TMB和MSI* | Targeted selection of DNA from 523 genes of interest, and RNA from 55 genes, for a total of 1.94Mb panel size. • Guideline Coverage: Broad coverage of key guidelines for multiple solid tumor types • Clinical Trials Coverage: Over 1,000 clinical trials • Immuno-oncology Biomarker Coverage: Biomarkers TMB and MSI included; also inclusive of HLA regions, POLE1 and POLD1*. | Targeted selection of DNA from 523 genes of interest, and RNA from 55 genes, for a total of 1.94Mb panel size. • Guideline Coverage: Broad coverage of key guidelines for multiple solid tumor types • Clinical Trials Coverage: Over 1,000 clinical trials • Immuno-oncology Biomarker Coverage: Biomarkers TMB and MSI included; also inclusive of HLA regions, POLE1 and POLD1*. |
| Hands-On Time | Manual: ~10.5 hrs Automated: N/A | Manual: ~10.5 hrs Automated: ~2.5 hrs | Manual: ~10.5 hrs Automated: ~2.5 hrs |
| Input Quantity | 30 ng cfDNA（8-10 ml血浆） | 40 ng DNA, 40 ng RNA | 40 ng DNA, 40-80 ng RNA (need at least 2 mm3 FFPE tissue) |
| Method | 靶向DNA测序 , 靶向富集 | 靶向DNA测序 , 靶向RNA测序 , 靶向富集 | 靶向DNA测序 , 靶向RNA测序 , 靶向富集 |
| Nucleic Acid Type | DNA | DNA, RNA | DNA, RNA |
| Specialized Sample Types | Blood, 游离DNA | FFPE Tissue | FFPE Tissue |
| Species Category | 人类 | 人类 | 人类 |
| System Compatibility | NovaSeq 6000 | NextSeq 500 , NextSeq 550 , NextSeq 550Dx in Research Mode | NovaSeq 6000 |
| Technology | 测序 | 测序 | 测序 |
| Variant Class | 体细胞变异, 单核苷酸位点变异 (SNV), 基因融合, 拷贝数变异 (CNVs), 插入缺失 (indels) | Transcript Variants, 单核苷酸位点变异 (SNV), 基因融合, 拷贝数变异 (CNVs), 插入缺失 (indels), 转录变异 | Transcript Variants, 单核苷酸位点变异 (SNV), 基因融合, 拷贝数变异 (CNVs), 插入缺失 (indels), 转录变异 |
* Based on PierianDx Clinical Genomics Knowledgebase, as of March 2020.
具体的方法工作流程范例
支持数据和图像
低VAF下的小变异检测
可重复的TMB测量
可重复的MSI测量
以高准确度检测低频变异
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