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20040534& Illumina Stranded mRNA Prep
- Illumina因美纳
- 生产商
- 20040534
- 现货
- 全国
| 规格 |
|---|
| Illumina Stranded mRNA Prep, Ligation (96样本) |
一个简单、可扩展、经济、快速的解决方案，只需25 ng标准（未降解）RNA，即可在一天之内对编码转录组实现快速分析。
产品特色
Illumina Stranded mRNA Prep提供了简化的RNA-Seq解决方案，可获得全转录组的清晰、全面分析。还可灵活地支持多种输入类型和起始量（最低低至25 ng总RNA）。Illumina Stranded mRNA Prep能够精确测量链方向，实现均匀覆盖，并发现高度可信的新亚型、基因融合和等位基因特异性表达等特征。
卓越的性能
Illumina Stranded mRNA Prep经过优化，可提供出色的polyA捕获效率和覆盖均一性。它极大减少了准确、无偏差地检测编码转录组所需的测序深度。Illumina Stranded mRNA Prep基于TruSeq连接技术，自2011年起已被至少9926篇文献引用。
灵活的研究设计
Illumina Stranded Total RNA Prep支持较宽的RNA起始量范围（25 ng–1000 ng）。*
精确测量链方向
此信息可支持检测反义转录、增强转录本注释和提高比对效率。
*与FFPE样本不兼容
快速、自动化的工作流程
7小时内即可制备好用于测序的文库。我们将通过自动化合作伙伴提供Illumina认证的自动化选项。
可扩展的测序
在单次运行中可多重分析最多384个样本。（Index Set A和B已上市，Set C和D即将推出。）
强大的RNA-Seq
RNA-Seq正逐渐成为业界思想领袖的理想平台，可以快速呈现转录组在特定时间点的详细快照。与定量PCR相比具有很多优势，包括：
无假设的实验设计，无需转录组的先验知识
更强的探索能力，可检测已知和新型转录本
更高的通量能力，每次检测可定量数百个至数千个区域
更广泛的动态范围，基因表达的检测更加准确
每次检测更多数据，提供全部序列和变异信息
规格
| Description | 简单、经济的编码转录组分析解决方案，可提供精确的链信息 |
|---|---|
| Content Specifications | 捕获编码转录组（带链信息） |
| Assay Time | 6.5小时 |
| Hands-On Time | ＜3小时 |
| Input Quantity | 25-1000 ng标准质量的总RNA |
| Mechanism of Action | PolyA捕获，连接接头和标签 |
| Multiplexing | 多达384个唯一双标签序列（UDI） |
| Species Details | Works with high-quality RNA from any species with polyA tails |
| System Compatibility Details | 文库制备被设计为与所有Illumina测序系统兼容，并在NextSeq 500/550和NovaSeq 6000系统上进行了大量的检验。 |
| System Compatibility | HiSeq 2500, HiSeq 3000, HiSeq 4000, NextSeq 1000, NextSeq 2000, NextSeq 500, NextSeq 550, NovaSeq 6000 |
| Variant Class | Novel Transcripts, Transcript Variants, 单核苷酸多态性 (SNPs), 基因融合, 转录变异 |
| Species Category | 小鼠, 人类, 大鼠, Mammalian, Bovine |
| Specialized Sample Types | Low-Input Samples, Not FFPE-Compatible |
| Strand Specificity | Stranded |
| Technology | 测序 |
| Automation Capability | 液体处理机器人 |
| Method | mRNA Sequencing |
| Nucleic Acid Type | RNA |
计划推荐
| 仪器 | 推荐的样本数 | 读长 |
|---|---|---|
| NextSeq 550 System | 中通量: 5 高通量: 16 （基于每个样本25 M reads） | 2 × 75 bp |
| NextSeq 2000 System | P2: 16 P3: 40 （基于每个样本25 M reads） | 2 × 75 bp |
| NovaSeq 6000 System | SP: 32 S1: 64 S2: 164 S4: 384 （基于每个样本25 M reads） | 2 × 75 bp |
产品比较
| Illumina Stranded mRNA Prep | TruSeq Stranded mRNA | TruSeq RNA Library Prep Kit v2 | Illumina RNA Prep with Enrichment | Illumina Stranded Total RNA Prep with Ribo-Zero Plus | |
|---|---|---|---|---|---|
| Automation Capability | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 | 液体处理机器人 |
| Strand Specificity | Stranded | Stranded | Non-Stranded | Non-Stranded | Stranded |
| Technology | 测序 | 测序 | 测序 | 测序 | 测序 |
| Variant Class | Novel Transcripts, Transcript Variants, 单核苷酸多态性 (SNPs), 基因融合, 转录变异 | Novel Transcripts, Transcript Variants, 单核苷酸多态性 (SNPs), 基因融合, 转录变异 | Novel Transcripts, Transcript Variants, 单核苷酸多态性 (SNPs), 基因融合, 转录变异 | Novel Transcripts, Transcript Variants, 单核苷酸多态性 (SNPs), 基因融合, 转录变异 | Novel Transcripts, Transcript Variants, 单核苷酸多态性 (SNPs), 基因融合, 转录变异 |
具体的方法工作流程范例
支持数据和图像
性能参数比较
左侧- Illumina Stranded mRNA Prep的性能参数。右侧- Illumina Stranded mRNA Prep与TruSeq Stranded mRNA比较。Illumina Stranded mRNA Prep显示出卓越的性能，尤其是使用UHR RNA的起始量为25 ng时。文库下采样至 30 M reads并使用BaseSpace RNA-Seq Alignment App v2.0.1进行分析。在4 M 下采样的双端reads通过过滤（PF）时报告重复。
低起始量下更多基因发现
与TruSeq Stranded mRNA相比，Illumina Stranded mRNA Prep可在低RNA起始量下检测到更多基因。在30 M下采样的双端reads PF中报告检测到的基因数。在1x覆盖度下检测到更多基因，Illumina Stranded mRNA Prep也是如此，这是更高灵敏度的一个指标。
与传统试剂盒高度一致
在（A）100 ng UHR RNA的等效起始量和（B）25 ng UHR RNA的较少起始量（对比100 ng UHR RNA）下，Illumina Stranded mRNA Prep产生的数据与TruSeq Stranded mRNA高度一致。
高数据一致性
Illumina Stranded mRNA Prep在（A）25 ng UHR RNA的技术平行分析和（B）25 ng 与100 ng UHR RNA 的起始量之间实现了高数据一致性。以2 × 74 bp读长对文库进行测序，下采样至30 M reads。使用BaseSpace RNA-Seq Alignment App v2.0.1进行数据分析。
Illumina Stranded mRNA Prep工作流程
Illumina Stranded mRNA Prep提供了快速的工作流程，且手动操作时间短。时间长短会因使用的设备、处理的样本数量、自动化程序或用户经验而异。
